MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. Dog2 genome

Total Repeats: 30938

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30502	NC_021881	AGA	2	6	1454801	1454806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526465348
30503	NC_021881	CAA	2	6	1454821	1454826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526465348
30504	NC_021881	CTA	2	6	1454863	1454868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526465348
30505	NC_021881	T	6	6	1454872	1454877	0 %	100 %	0 %	0 %	526465348
30506	NC_021881	TCC	2	6	1455062	1455067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526465348
30507	NC_021881	TTG	2	6	1455102	1455107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526465348
30508	NC_021881	TAC	2	6	1455136	1455141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526465348
30509	NC_021881	CTT	2	6	1455170	1455175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526465348
30510	NC_021881	AGC	2	6	1455248	1455253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526465348
30511	NC_021881	AAC	2	6	1455278	1455283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526465348
30512	NC_021881	TAG	2	6	1455305	1455310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526465348
30513	NC_021881	TAC	2	6	1455337	1455342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526465348
30514	NC_021881	CAC	2	6	1455403	1455408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526465348
30515	NC_021881	TGT	2	6	1455448	1455453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526465348
30516	NC_021881	TG	3	6	1455496	1455501	0 %	50 %	50 %	0 %	526465348
30517	NC_021881	TC	3	6	1455553	1455558	0 %	50 %	0 %	50 %	526465348
30518	NC_021881	CAC	2	6	1455637	1455642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526465348
30519	NC_021881	TCA	2	6	1455663	1455668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526465348
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30522	NC_021881	TAA	2	6	1455725	1455730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30523	NC_021881	AT	3	6	1455814	1455819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30524	NC_021881	ATT	2	6	1455909	1455914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30525	NC_021881	TCT	2	6	1455962	1455967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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30527	NC_021881	AAT	2	6	1456021	1456026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30528	NC_021881	TAA	2	6	1456041	1456046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30529	NC_021881	ATTT	2	8	1456060	1456067	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30530	NC_021881	T	6	6	1456071	1456076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30536	NC_021881	TA	3	6	1456388	1456393	50 %	50 %	0 %	0 %	526465349
30537	NC_021881	TC	3	6	1456408	1456413	0 %	50 %	0 %	50 %	526465349
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30539	NC_021881	TTG	2	6	1456587	1456592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526465349
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30541	NC_021881	ATAC	2	8	1456745	1456752	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30542	NC_021881	ACT	2	6	1456761	1456766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30543	NC_021881	AAC	2	6	1456841	1456846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30544	NC_021881	ACT	2	6	1456862	1456867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30545	NC_021881	AGA	2	6	1456888	1456893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30546	NC_021881	ATT	2	6	1456922	1456927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30547	NC_021881	T	6	6	1457063	1457068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30548	NC_021881	ACA	2	6	1457115	1457120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30549	NC_021881	TAT	2	6	1457128	1457133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30550	NC_021881	TGA	2	6	1457151	1457156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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30552	NC_021881	C	6	6	1457241	1457246	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
30553	NC_021881	CAT	2	6	1457254	1457259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30554	NC_021881	GCA	2	6	1457279	1457284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30555	NC_021881	CTA	2	6	1457289	1457294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30556	NC_021881	AGC	2	6	1457371	1457376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30557	NC_021881	TGC	2	6	1457407	1457412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30558	NC_021881	GAT	2	6	1457427	1457432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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30560	NC_021881	CGC	2	6	1457479	1457484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30561	NC_021881	AATA	2	8	1457512	1457519	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30562	NC_021881	AGAA	2	8	1457533	1457540	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30563	NC_021881	ACC	2	6	1457563	1457568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30564	NC_021881	CTA	2	6	1457595	1457600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30565	NC_021881	CAA	2	6	1457601	1457606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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30567	NC_021881	ACC	2	6	1457736	1457741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30568	NC_021881	AT	3	6	1457774	1457779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30569	NC_021881	GA	3	6	1457821	1457826	50 %	0 %	50 %	0 %	526464716
30570	NC_021881	CAT	2	6	1457856	1457861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464716
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30572	NC_021881	TAC	2	6	1457898	1457903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464716
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30579	NC_021881	CAG	2	6	1458045	1458050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464716
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30588	NC_021881	T	6	6	1458477	1458482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30589	NC_021881	GCA	2	6	1458483	1458488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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30591	NC_021881	CGA	2	6	1458586	1458591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464717
30592	NC_021881	ACT	2	6	1458630	1458635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464717
30593	NC_021881	GGC	2	6	1458661	1458666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526464717
30594	NC_021881	GAA	2	6	1458683	1458688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464717
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30596	NC_021881	TTACA	2	10	1458765	1458774	40 %	40 %	0 %	20 %	526464717
30597	NC_021881	A	6	6	1458870	1458875	100 %	0 %	0 %	0 %	526464717
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30600	NC_021881	GCT	2	6	1459003	1459008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30601	NC_021881	GA	3	6	1459043	1459048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30602	NC_021881	TGC	2	6	1459056	1459061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30603	NC_021881	CTT	2	6	1459260	1459265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526465350
30604	NC_021881	AAC	2	6	1459297	1459302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526465350
30605	NC_021881	AAG	2	6	1459318	1459323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526465350
30606	NC_021881	CAA	2	6	1459374	1459379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526465350
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30609	NC_021881	T	6	6	1459425	1459430	0 %	100 %	0 %	0 %	526465350
30610	NC_021881	GTC	2	6	1459456	1459461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526465350
30611	NC_021881	TTC	2	6	1459497	1459502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526465350
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30615	NC_021881	GTC	2	6	1459591	1459596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526465350
30616	NC_021881	TGG	2	6	1459683	1459688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526465350
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30618	NC_021881	CTT	2	6	1459717	1459722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526465350
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.